pymol 讓我的蛋白變得好美麗

先從 PDB 找到喜歡的protein

再利用 pymol

輸入在PDB上的代號

就可以直接load in protein的結構

可以將各個chain改成美麗的顏色

也可以選擇呈現的方式

或讓他旋轉360度

並focus在此蛋白特殊的structure放大

可算出原子與原子或原子與peptide間的距離

pymol 用途很多

可以從 pymol tutorial 找到一些基本的用法

protein： crystal structure of human extracellular copper-zinC superoxide dismutase
                   ( extracellular superoxide dismutase(CU-ZN))

length：222